1936年，国立药学专科学校时期设有体育运动委员会，体育工作最高议事机构由校长或训导主任为主席。还设立体育干事会，为全校体育事业的推行机关。
1949年，学校设立体育组，下属教务处。
1950年，学校更名为华东药学专科学校。1951年，学校成立由体育教师、工会文教部、学生会文娱部、青年团总支等单位参加的文娱体育委员会，隶属校务委员会。
1952年，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入学校，成立华东药学院。1955年，学校设立健康委员会，以副院长、教务处、总务处、学生会、学生工作科、医务室及体育教研组的负责人为委员，共同领导全院体育工作。
1956年学校更名为南京药学院。1982年，为加强对体育工作的领导，学校调整了体育运动委员会，由分管体育的副校长担任负责人，秘书处设在体育教研室，统筹全校体育工作，该机制沿用至今。
1986年，学校与筹建中的南京中药学院合并，成立中国药科大学。
1993年，全校教研室调整，体育教研室隶属于基础部。
1995年，学校成立体育部，为系级建制，由分管体育的副校长直接领导，成为学校独立的教学科研部门，主要承担体育教学、群体活动、运动竞赛、体质测试、场馆管理等任务。
2019年，体育部深化“体药融合”理念，论证并成立体药融合创新研究中心
2021年，中共中国药科大学体育部总支部委员会更名为中共中国药科大学体育部委员会，党的组织建设进一步加强，为事业发展提供坚强政治保障。
2023年，体育部获批设置“运动药学与健康促进”硕士点，并于2024年招生
2023年，体育部与南京市体育医院合作共建“运动药学与健康促进临床基地”，开启体药交叉学科建设新篇章。
2024年，研究制定《中国药科大学关于加强和改进新时代学校体育工作的实施意见》；校企合作助力校园赛事发展，成功举办第一届“药大·圣和药业”兴药杯秋季杯赛。
2025年，成功举办中国学体联大学健美操与艺术体操分会年度工作会议等。我校学子精彩亮相“苏超”半决赛、南京“村超”开幕式和新农社区“村晚”表演等。
2026年，研究制定《中国药科大学大学生体质提升专项行动实施方案》；室内恒温游泳馆改扩建工程圆满落成并隆重开馆；成功举办中美排球友谊交流赛、第一届“药大·花红药业”兴药杯春季联赛等。
体育部现下设办公室、两个教学教研室、群体教研室、体质测试中心、运动竞赛管理中心、体药融合研究中心、体育场馆中心等机构。
三、社会任职
中国学生体育联合会大学健美操与艺术体操分会副主席单位
原中国学生体育联合会大学排球分会副主席单位
江苏省学校体育联合会高校健美操、啦啦操运动联盟主任单位
江苏省体育科学学会理事单位
江苏省射箭协会理事单位
江苏省石锁运动协会理事单位
江苏省台球运动协会理事单位
南京市健美操（啦啦操）协会理事单位
四、师资队伍
部门现有教职工49人，其中专任教师42人。正高级1人，副高级25人，中级17人；博士后1人，博士5人，硕士29人；国际级裁判3人次，国家级裁判6人，一级裁判员26人，运动健将10人。
系统构建了“CPU-SPORTS”四级竞赛体系（班级—学院—校级—校际），形成贯穿全年的体育竞赛平台。持续打造校田径运动会、“药大·花红”兴药杯春季联赛、“药大·圣和”兴药杯秋季杯赛、师生趣味运动会、校园啦啦操比赛、“远志”校园马拉松、“神农”中医药传统体育运动会等全校性师生体育活动。鼓励各学院开展“一院一品”特色活动，形成人人参与、层层递进的群众体育热潮。以大型团体操表演为载体，扩大零基础学生参与面，形成全年火热、全员参与的体育新生态。积极承办江苏省运动会高校部健美操比赛、江苏省大学生街舞锦标赛等省级及以上品牌赛事，以高质量办赛搭建交流平台，展现学校综合实力，获得教育部学生体育协会、省教育厅、省体育局及参赛高校的高度评价。
近十年来，校运动队在全国大学生体育比赛中，荣获第一名38次、第二名19次、第三名27次、第四至八名86次；在省部级大学生体育比赛中，夺得第一名64次、第二名52次、第三名34次、第四至八名106次。排球、健美操两支高水平运动队成绩在省内处于领先地位，多次在国家级比赛中获得佳绩。曾获全国第一届学生（青年）运动会大学排球男子组冠军、全国啦啦操比赛多项冠军，以及江苏省运会高校部排球、沙滩排球冠军和健美操四项冠军及总分第一等佳绩。
八、榜样育人
深度发掘体育育人力量，做好体育“加法”，促进五育融合。特邀校运会长跑记录保持者、原中国药学会理事长孙咸泽与师生代表欢聚一堂，共话体育育人；邀请奥运冠军王赐月校运会现场送祝福，深入“一站式”学生社区分享奥运精神；邀请排球奥运冠军赵蕊蕊，羽毛球世界冠军刘雨辰、李俊慧、何冰娇等，与师生面对面，话成长、展球技，点燃体育热情，激励成长成才。
1.校排球、沙滩排球队
我校排球队成立于1985年，历经多年探索与积淀，于2005年组建高水平男、女子排球队。多年来，在学校与体育部的大力支持下，队伍常年位列中国大学生排球联赛男子组前八名。2023年，我校男子排球队教练员与运动员代表江苏省大学生男子排球队，勇夺第一届中华人民共和国学生（青年）运动会大学组男子排球冠军；同时蝉联第二十届、第二十一届江苏省运动会高校部甲A组男子排球比赛冠军。男子沙滩排球队多次斩获中国大学生沙滩排球锦标赛、精英赛亚军及季军，并在第十九届江苏省运动会中夺得男子甲组冠军，多次获评“体育道德风尚奖”。女子沙滩排球队则多次闯入全国大学生锦标赛、精英赛前六名，并在第二十一届省运会中获得甲组第六名，同样多次荣获道德风尚奖。
2.校武术队
我校武术队成立于2001年，是学校首支高水平运动队。2004年与2007年，队伍连续两届代表江苏出征四年一届的全国大学生运动会，以优异成绩超额完成代表团任务；在第十六届江苏省运会中斩获高校组冠军。每年在全国大学生武术锦标赛等各级赛事中累计获奖逾30项。队伍曾连续三年与荷兰国家武术队开展友好交流，并积极参演校庆、开学毕业典礼、校运会开幕式等校园大型活动，广受师生好评。武术队以武育德、以武强身，为丰富校园文化、展示学子风貌、传承中华优秀传统文化持续贡献着力量
3.校健美操、啦啦操队
校健美操、啦啦操队成立于2002年，是学校传统优势代表队。历经二十余年发展，已成长为江苏省乃至全国普通高校同类项目中的标杆队伍。依托原高水平运动队积淀的扎实技术体系，队伍建立起“从普及到提高”的选拔培养机制：以校级啦啦操协会为基础，面向全校开放普及训练，择优组建正式代表队，并将队员分散至各院系担任体育骨干，带动项目全面推广。队伍常年征战国家级、省级赛事，近期成绩斐然：2024年中国大学生啦啦操锦标赛斩获三金一银（甲组小团体技巧、自选小团体混合四级、自选集体四级三项冠军，规定集体混合技巧亚军）；第18届中国大学生健美操锦标赛（2024）获甲组校园中级健美操亚军；第19届全国大学生健美操锦标赛（2025）获甲A组自选男单季军，实现学校在该项目个人赛的历史性突破。江苏省第20届运动会高校部健美操比赛中，队伍包揽混双、三人、五人操三项冠军及团体总分第一，并获道德风尚奖；第21届省运会再夺四项冠军，蝉联团体总分第一。
4.校田径队
校田径队成立于20世纪80年代，是学校征战赛场的老牌劲旅。在专业教师指导下，队伍坚持系统化科学训练，近十年来共斩获省运会金牌7枚、全国大学生田径锦标赛铜牌2枚，并多次刷新校纪录。常规训练安排在每周一、三、五下午四点半于体育场进行，同时不定期组织球类对抗、力量健身等辅助活动，以及春日徒步、跨年聚会、毕业生欢送会等丰富团建，营造出既有竞技热血、亦有温情陪伴的队伍氛围。无论是否具备运动基础，只要你热爱奔跑与拼搏，田径队都热忱欢迎你的加入，一同挥洒汗水、书写耀眼青春。
5.校男子足球队
校男子足球队自1995年成立以来，始终活跃在校园足球一线。从一代代队员的接力传承，到战术风格的逐步成型，不变的是对足球的赤诚热爱与对胜利的执着渴望。球队坚持每周系统训练，涵盖力量、技术与战术配合，并常与校外球队开展友谊赛以检验实战水平。队伍风格严谨、执行力强，2026年获江苏省第21届运动会高校部足球（甲B男子组）第四名；2025年获省长杯暨省运会预选赛第七名并荣膺体育道德风尚奖，接连刷新药大男足历史战绩。队内氛围融洽，本科生与研究生并肩作战，建立了深厚情谊。球队还积极组织“兴药杯”等校内赛事，带动更多同学走近足球，营造独具药大特色的足球文化。
6.校跆拳道
我校跆拳道队成立于2003年，始终坚持竞技发展方向，深耕赛场、奋勇拼搏。2004年于南京高校大学生跆拳道比赛斩获1冠4亚；2006年在江苏省大学生跆拳道比赛中拿下4项冠军；2009年获第十七届省运会跆拳道高校部冠军1项；2021年获第17届中国大学生跆拳道锦标赛亚军；2024年在第18届锦标赛南方赛区获亚军并在总决赛取得季军；2025年再获第二十一届省运会高校部冠军。队伍常年征战江苏省大学生跆拳道锦标赛，多次夺魁，团体总分稳居前五，是省内极具实力的传统强队。
7.校女子足球队
女子足球队组建于2005年，十余年来驰骋江苏高校绿茵赛场，成长为极具竞争力的老牌劲旅。队员来自多个专业，覆盖本科生至博士研究生。球队主打防守反击，作风坚韧沉稳，先后两次夺得省长杯亚军，并在江苏省第十九届、第二十一届运动会高校部甲B组中收获银牌，第二十届省运会勇夺金牌。队伍始终秉持文明参赛理念，多次获评赛事道德风尚奖，恪守尊重对手、尊重裁判的准则，竞技实力与体育品德兼备，以热爱与毅力不断突破自我，展现药大学子奋勇争先的精神风貌。
8.校网球队
校网球队成立于2006年，是以普通生为主体的活力队伍。在学校和体育部的关心支持下，球队稳步发展、屡创佳绩。主要成绩包括：2006年第十六届省运会女团第八名；2013年第十八届省运会男单第四名、男双第五名；2022年第二十届省运会男双第七名；2025年第二十一届省运会男团第七名。队伍将继续秉持积极进取的精神，在今后的赛事中争取更大突破。
9.校乒乓球队
校乒乓球队成立于2007年。当年12月，袁媛便在江宁区赛事中一举夺得女团、女单双料冠军，为这支新生队伍赢得开门红。四届省运会、四次闯入前八——这是药大乒乓球队交出的扎实成绩单。二十年间，队员更迭交替，但拼搏精神与团队荣誉感如接力棒般代代相传。安琳作为国家二级运动员，球技与学业兼优，从本科至博士期间代表学校参加两届省运会，两度摘得团体与单项双料亚军。韩涵同样战绩辉煌，省运会亚军、药大博士毕业、留校任教，其成长轨迹正是球队“双优”理念的最佳体现。乒乓球队用二十年证明：体育与学业可以并进，赛场上的拼搏精神同样能在学术道路上绽放光芒。
10.校棒垒球队
校棒垒球队成立于2013年，由原江苏省棒垒球队队员与校内教师共同执教，搭建起覆盖基础技术与战术配合的完整训练体系。队伍始终秉持以体强身、以体育人的理念，注重基本功打磨与团队协作培养，于2026年江苏省大学生慢投垒球锦标赛荣获三等奖。未来，球队将进一步完善分层训练体系，强化意志品质塑造，同时打造校内棒垒球体验活动，拓展校际文体互动，持续推动我校棒垒球运动高质量发展。
11.校射艺队
校射艺队成立于2017年，秉持“射以观德”精神，依托科学训练迅速成长为全国高校劲旅。2023年获第五届中国大学生射箭（射艺）锦标赛女子团体第六名及体育道德风尚奖；2022年中国大学生线上射箭（射艺）锦标赛获混合团体第七名及道德风尚奖。在ACAC射箭俱乐部联赛2024赛季南京站中，夺得女子传统弓排位赛第三名、淘汰赛第二名；2024年江苏省射箭俱乐部联赛（大学生组）斩获个人排位第一名、第三名、第六名，淘汰赛第一名、第二名；2025年全国射御运动会（南京站）暨全国民族体育射艺公开赛上，更摘得女子传统弓排位赛第一名、淘汰赛第二名，女子反曲弓排位赛第五名、淘汰赛第三名，男子反曲弓排位赛第二名、淘汰赛第一名等多项荣誉，充分彰显我校射艺底蕴与实力。
12.校体育舞蹈队
校体育舞蹈队成立于2019年，是一支兼具专业性与凝聚力的队伍，涵盖摩登、拉丁等多个舞种。队员们刻苦训练、默契协作，在省级及国家级赛事中屡创佳绩。2026年，在第十九届中国大学生体育舞蹈（国标舞）锦标赛中斩获甲组单项牛仔舞第三名、甲组单项伦巴舞第二名；2025年，在第十八届锦标赛中夺得甲组单项牛仔舞冠军、伦巴舞第五名、6人华尔兹舞第四名及6人探戈舞第四名。赛场之外，队伍积极参与各级赛事开幕式、社团风采展、校庆等校园活动，用灵动舞步点缀校园生活，以优雅姿态传递体育舞蹈魅力，成为药苑中一道兼具美感与力量的独特风景线。
13.校排舞队
排舞队于2021年组建，经过教练员悉心指导与队员不懈努力，五年来为学校赢得诸多荣誉。2021年江苏省大学生排舞锦标赛获自选舞台套路第二名、规定套路第三名；同年“舞动中国排舞联赛”线上总决赛获开放项目一等奖、规定套路二等奖。2022年中国大学生健康活力“云”系列大赛获中国风健身舞线上赛第一名；同年“舞动中国排舞联赛”获女生小集体规定套路一等奖；省锦标赛获小集体自选第二名、规定第三名、中级串烧第二名、团体第三名。2023年省锦标赛获小集体自选第一名、规定第四名、串烧第四名、团体第三名。2024年获自选第四名、串烧第四名；2025年获自选第五名、规定第七名、串烧第四名及团体第七名。队伍将再接再厉，争取更好成绩。
14.校击剑队
校击剑队成立于2022年，以重剑项目为核心，汇聚全校热爱击剑运动的学子。队伍秉持“剑修品格、砺志笃行”的理念，将击剑所蕴含的专注、果敢与尊重礼仪的骑士精神，融入药大学子严谨治学的底色之中。队伍坚持系统化日常训练，精进步伐、攻防战术与临场应变能力。2023年与2024年全国大学生击剑锦标赛中，连续两次斩获男子重剑个人铜牌；2025年锦标赛获女子甲组重剑团体第四名及个人第五名；2026年江苏省大学生击剑锦标赛上，队伍奋勇拼搏，拿下3金2铜，充分展现不畏强手、协同作战的风貌。击剑被誉为“格斗中的芭蕾”，队伍同时积极推广击剑文化，面向爱好者开展基础教学，搭建运动交流平台，以剑为媒，传递积极向上的校园体育精神。
15.校飞镖队
校飞镖队成立于2023年，是学校极具特色的竞技体育代表队，秉持以镖健体、以镖砺志、以镖育人的理念，深耕飞镖特色项目。现有在练队员约15人，覆盖多个年级与专业。队伍专注竞技提升，在全省高校强队中脱颖而出：2026年江苏省第21届运动会高校部飞镖比赛中，凭借扎实基本功与默契配合斩获男子双人第三名；2023至2025年连续三届江苏省大学生飞镖锦标赛中，取得女双第三名等亮眼成绩，并连续三年荣获“体育道德风尚运动队”称号，连续在省级两大重磅赛事中跻身前三，刷新我校飞镖项目历史最佳战绩。
16.校羽毛球队
校羽毛球队成立于2024年，秉持“勤学苦练、团结协作、勇攀高峰”的队训，通过专业系统训练全方位提升竞技水平。组队以来积极征战各级赛事，不断实现突破：2025年VICTOR第二届“行知杯”高校羽毛球团体邀请赛中勇夺团体冠军，收获建队首冠；在江苏省第21届运动会高校部羽毛球赛中，斩获女双第四名、男团第五名、男单第五及第六名、甲B组团体总分第七名，并首次摘得省运会羽毛球项目“道德文明风尚奖”，取得历史性突破。球队积极协助举办世界冠军进校园（刘雨辰、李俊慧、刘永、戴韫、汤金华、何冰娇、夏玉婷等）及2025VICTOR双塔杯公开赛等交流活动，并与VICTOR品牌达成合作，获得专业装备赞助，为持续提升竞技水平提供有力保障。
17.校舞龙队
校舞龙队成立于2025年，建队之初便站上省级赛场，在江苏省第二十一届运动会高校部龙狮比赛舞龙规定套路中荣获甲组第八名。作为极具观赏性的传统体育项目，舞龙队多次亮相中美排球友谊交流赛、校田径运动会、“兴药杯”系列赛事、校传统体育运动会等大型活动开幕式。金鳞逐风，龙腾药苑，队员们怀揣热血与初心，以青春之力传承弘扬中华优秀传统文化。
18.校游泳队
校游泳队于2026年正式组建，同年5月首次参加江苏省第21届运动会高校部游泳比赛（甲B组）。在校内游泳馆尚未投入使用、训练条件受限的情况下，队员们克服困难，创造了学校在该项目上的历史最好成绩：女子200米混合泳第四名、女子100米自由泳第四名、女子50米蝶泳第五名、男子50米蛙泳第五名、女子400米自由泳第七名、男子50米自由泳第七名，充分展现了“更快、更高、更强、更团结”的奥林匹克精神。未来，队伍将依托学校新建游泳馆开展系统训练，持续推动校园游泳项目发展，成为体育育人体系中的重要力量。
19.校匹克球队
校匹克球队成立于2026年，是新兴特色竞技队伍。教练团队持有WPTF认证资质并拥有丰富赛事经验，为队员提供专业技术、战术与竞赛指导。现有正式队员二十余人，竞技氛围浓厚。队伍先后参加阿伦纳斯杯匹克球巡回赛、紫金山科技城匹克球竞赛等校外赛事，并在“药育杯”“花红·药大”匹克球比赛等校园赛事中稳定发挥，多次包揽男单、女单、双打项目冠亚季军。目前队内已有3名队员取得中国网球协会二级裁判员证书，具备自主策划组织赛事的能力。未来，球队将持续夯实竞技实力，积极开展推广活动，吸引更多同学参与匹克球运动。
20.校攀岩队
校攀岩队成立于2026年，依托校内攀岩运动发展需求组建，目前仍处于夯实基础、打磨能力的起步建设阶段。全队以备战第二十二届全国大学生攀岩锦标赛为核心目标，是校内攀岩爱好者的汇聚阵地。日常常态化联动江苏省内多所兄弟高校开展技术交流、户外野攀、联合拉练等活动，队伍氛围团结奋进、作风积极向上。秉持脚踏实地、精进不休的理念，随着训练体系持续完善与参赛经验不断积累，未来有望在各级攀岩赛事中突破自我、斩获佳绩。